2013年杭州港全年完成货物吞吐量9381.61万吨，同比增长3.01%。其中进口量5796.74万吨，同比减少3.2%；出口量3584.87万吨，同比增长13.12%；其中京杭运河干线港区(运河、余杭港区)完成货物吞吐量4974.26万吨，同比基本持平。内河其他港区完成货物吞吐量为4407.35万吨，同比增长6.72%；集装箱完成2182TEU；完成旅客吞吐量418.07万人次，同比减少21.39%。旅客吞吐量数据来源淳安港区千岛湖旅客量。

　　主要货种如钢铁、矿建材料，煤炭和水泥吞吐量有较大增幅，石油、非金属矿石和粮食吞吐量同比有所下降。水泥吞吐量同比增长19%，是杭州港增长较快货种，2013年由于杭州主城区城建和地铁等重点工程快速建设，加大水泥需求量，吞吐量增长明显。矿建材料(石子)出口同比增长8.4%；富阳港区贡献度最大，由于湖州、余杭等地矿山产业整治关停，大量货源需求向富阳辖区转移。矿建材料(石子)货源减少而价格走高，供需矛盾突出，促进富阳港区的矿建材料出口上海、嘉兴等地需求量大幅增加。

　　2013年完成旅客吞吐量418万人次，同比有较大幅度的下降，几方面原因产生：首先受宏观经济的调控政策和“三公”经费限制等因素的影响，团体旅游及会议明显减少；散客近年来趋向“乡村游”、“农家乐”等其他形式，陆路交通日趋便捷，旅游人数逐渐增加，水运旅客量出现分流。其次是今年恶劣天气较多，如台风、雾霾天等，以及禽流感事件导致外出旅游的意愿下降，旅客量减少。

　　2014年，随着“三江两岸”生态建设和码头整治，2013年共减少154个码头泊位，2014年钱塘江上流水治理将全面铺开，临时性码头泊位数量又会减少，吞吐量减少是必然。随着2014年富阳口岸整体搬迁入驻杭州东洲综合码头，码头集装箱吞吐量预测突破2万箱量(其中内贸10000TEU，外贸10000TEU)。